El Directorio de ENDE es el máximo órgano de definición de lineamientos estratégicos institucionales, de control y fiscalización. Está conformado por los siguientes miembros:
La Ministra o Ministro de Hidrocarburos y Energías o su representante.
La Viceministra o Viceministro de Electricidad y Energías Renovables o su representante.
La Ministra o Ministro de Economía y Finanzas Públicas o su representante.
La Ministra o Ministro de Producción Sostenible, Medio Ambiente y Agua o su representante.
La Ministra o Ministro de Obras Públicas, Servicios y Vivienda o su representante.
